Start vom Kosmodrom Baikonur; Landung in der Steppe von Kasachstan (88 km nordöstlich von Arkalyk).

Nach zweitägigem Alleinflug koppelte die Sojus am 03.07.1994 an die Raumstation MIR an. Nach der Übergabe der Station durch die 15. Stammbesatzung bildeten die beiden Kosmonauten zusammen mit dem Langzeit-Kosmonauten Poljakow die 16. MIR-Stammbesatzung. Zum ersten Mal seit 17 Jahren (damals mit der Mission Sojus 25), wurde eine sowjetische Mission gestartet, bei dem alle Besatzungsmitglieder Weltraumneulinge waren.

Medizinische Versuche zur Erforschung der Schwerelosigkeit bei Langzeit-Flügen wurden durchgeführt. Daneben unternahm die Besatzung materialwissenschaftliche Experimente (so z.B. Halbleiter, Metalllegierungen), aber auch Instandsetzungsarbeiten und Forschungen auf den Gebieten Erderkundung, Astrophysik und Biotechnologie.

EVA`s wurden durch Malentschenko und Mussabajew am 09.09.1994 (5h 06m) und 14.09.1994 (6h 01m) unternommen. Dabei wurde die Isolierung der Station repariert. Während des Fluges traten zahlreiche Probleme auf, die dazu führten, dass Malentschenko erstmalig ein Versorgungsraumschiff vom Typ Progress manuell an die Raumstation docken musste.