Start von Cape Canaveral (KSC); Landung auf Cape Canaveral (KSC). Wegen technischer Probleme wurde ein erster Startversuch am 1. Dezember 1998 abgesagt.

Erster Aufbau-Flug für die ISS (ISS-01-2A); Ankopplung der mitgeführten Einheit Unity an das russische Modul Sarja. Dabei wurden die drei miteinander verbundenen Teile mit dem Manipulatorarm aus der Ladebucht heraus gehoben und auf den Kopplungsadapter der Raumfähre gesetzt. Aus etwa zehn Metern Entfernung wurde es am 6. Dezember 1998 vom Greifarm der Raumfähre erfasst und auf den zweiten Kopplungsadapter von Unity gesetzt.

Danach führten Ross und Newman zwei EVA's zur Verkabelung der beiden Bauteile am 7.12.1998 (7h 21m) und 9.12.1998 (7h 2m) durch.

Inbetriebnahme der Raumstation ISS durch Cabana und Krikaljow. Dritte und letzte EVA durch Ross und Newman am 12.12.1998 (6h 59m), bei der nochmals die Kabelverbindungen überprüft und verbessert wurden. Außerdem testeten sie die SAFER-Notrettungs-Rucksäcke. Auch die zweite Antenne des russischen Navigationssytems Kurs konnte manuell vollständig ausgefahren werden.

Im weiteren Verlauf des Fluges wurde der kleine argentinische Test-Satelliten SAC-A (Satelite de Aplicaciones/Cientifico) ins All ausgesetzt.