Start vom Kosmodrom Baikonur; Landung 225 km südöstlich von Dsheskasgan.

Sojus 40 war der neunte und letzte Interkosmos-Flug. An Bord befand sich auch der Rumäne Dumitru Prunariu als Gastkosmonaut. Nach eintägigem Alleinflug koppelte Sojus 40 am 15. Mai 1981 mit Saljut 6 und es folgten gemeinsame Arbeiten mit der fünften Stammbesatzung. Mit Sojus 40 wurde die letzte Ankopplung an diese Orbitalstation ausgeführt.

Verschiedene wissenschaftliche Forschungen und Experimente einschließlich Untersuchungen des irdischen Magnetfeldes mussten von der Besatzung ausgeführt werden. Erdbeobachtungen wurden erst am letzten Tag der Mission gemacht, als man über Rumänien flog. Daneben wurde auch noch einmal das Orientierungssystem der Station getestet.

Kern der relativ einheitlichen Interkosmos-Missionen waren Originalübertragungen des Starts, von Gesprächen mit den jeweiligen Partei- bzw. Staatschefs und Grüße an die Heimatbevölkerung. Daneben wurden Beobachtungen und Aufnahmen (auch multispektral mit MKF 6 des Heimatlandes des Gastes, medizinisch-biologische Untersuchungen und Experimente mit landestypischen Produkten durchgeführt. Der Gastbesuch war auf ca. sieben Tage und 21,5 h (mit nur einer Toleranz von +/- einer Stunde) ausgelegt. Die Vorbereitung dieser Missionen benötigte nicht besonders viel Zeit, da auf meist in der Sowjetunion ausgebildete (also sprachkundige) Militärflieger zurückgegriffen werden konnte.