Start vom Kosmodrom Baikonur. ISS Expedition 50 / 51.

Nach etwa zweitägigem Alleinflug koppelte Sojus MS-03 am 19. November 2016 an die ISS an. Oleg Nowizki, Thomas Pesquet und Peggy Whitson bildeten die ISS Expedition 50 (zusammen mit den ISS Expedition 49 Crewmitgliedern Sergej Ryshikow, Andrej Borissenko und Shane Kimbrough). Mit der Ankunft von Sojus MS-03 wurde die Stammbesatzung wieder auf sechs Personen aufgestockt.
Während des zweitägigen Fluges von Kosmodrom Baikonur zur Internationalen Raumstation unterzog die Besatzung alle Systeme des überarbeiteten Raumschiffs Sojus MS-03 eingehenden Tests. Das modifizierte Sojus-Raumschiff verfügt über verbesserte Triebwerke einschließlich eines Reservesystems, zusätzlichen Schutzschilden gegen Mikrometeoriten, elektrische Ersatzmotoren für das Sojus-Kopplungssystem und durch Erhöhung der Solarzellen eine höhere Energieversorgung.